对于在深圳运营的外商投资企业而言，了解并掌握出口退税的申请流程至关重要。出口退税是国家为鼓励出口而实施的一项税收优惠政策，旨在减轻出口企业的税负，提升其在国际市场上的竞争力。以下是深圳外商投资企业申请出口退税的完整流程：

1. 准备相关软件与系统

首先，企业需通过官方网站下载外贸企业出口退税申报系统，并注册登录出口退税网站。

2. 录入并审核出口明细数据

在退税系统中录入出口货物的详细信息，并进行数据审核，确保信息准确无误。

3. 获取增值税发票并验证信息

取得增值税专用发票后，应在30日内通过“发票鉴证系统”或国家税务总局网站查询发票真伪及有效信息。

4. 录入并审核采购明细数据

将采购的原材料或商品信息录入退税系统，并完成相应的审核工作。

5. 生成预申报数据

通过系统中的“数据处理”模块，进行“进出口数量关联检查”和“汇兑成本检查”，生成预申报数据。

6. 在线预申报与反馈

将预申报数据提交至系统，等待审核结果。根据反馈意见进行调整。

7. 输入文件归档数据

在系统中录入相关的文件归档信息，确保资料齐全。

8. 正式申报

初审通过后，正式提交出口退税申请，并确认预申报数据的准确性。

9. 打印报表并准备申报材料

打印出口报关明细表、进货明细表、出口退税申报汇总表各两份，并准备包含12份单据的退税软盘。软盘上需注明企业名称及海关代码。

10. 提交退税申请

最后，携带所有准备好的材料到当地税务部门进行正式申报。

提示：企业应确保所有数据真实、完整，以提高退税申请的成功率。