对于持有中国境内公司股权的香港公司，在进行股权转让时，需关注相关的税务责任与适用税率。以下是详细说明：

1. 企业所得税

根据《中华人民共和国企业所得税法》及《国家税务总局关于非居民企业所得税源泉扣缴有关问题的公告》，非居民企业（如香港公司）转让中国境内企业股权所取得的所得，应在中国缴纳企业所得税。

  • 适用税率：一般为10%（若无税收协定优惠）。
  • 计税依据：股权转让收入减去股权原值及相关合理费用后的余额。

2. 税款扣缴义务人

在股权转让交易中，支付股权转让款的一方（即买方）通常承担代扣代缴税款的责任。

3. 税收协定影响

如果香港与内地之间有税收协定（如《内地与香港特别行政区关于避免双重征税的安排》），可能适用更低的税率或免税条款，具体需根据交易性质及协议内容判断。

4. 其他潜在税费

除企业所得税外，还可能涉及：

  • 印花税：由转让方或受让方缴纳，税率通常为0.05%。
  • 增值税：若股权转让被视为“金融商品转让”，可能适用6%的增值税。

建议在进行股权转让前，咨询专业税务顾问，以确保合规并优化税务负担。