在跨境股权转让中，涉及的税务问题往往较为复杂，尤其是在涉及境内公司与境外公司之间的交易时。以下是对该问题的详细解析：

一、香港是否需要对股权转让所得征税

根据香港《税务条例》，香港对“应评税盈利”征收净收益税，但该税项仅适用于在香港产生或来源于香港的收入。

  • 关键点： 若香港公司转让的是内地公司的股份，其所得属于中国内地来源，而非源自香港。
  • 结论： 因此，该股权转让所得不属于香港的课税范围，无需缴纳香港净收益税。

二、中国是否需要对该股权转让所得征税

根据《中华人民共和国企业所得税法》（以下简称《企业所得税法》）第三条第三款的规定，非居民企业在我国境内未设立机构、场所，或虽设立机构、场所但取得的所得与其所设机构、场所没有实际联系的，应当就其来源于中国境内的所得缴纳企业所得税。

  • 适用对象： 香港公司作为非居民企业，若其股权转让所得来源于中国境内，则需在中国纳税。
  • 税率： 根据《企业所得税法》第四条第二款及《企业所得税法条例》第九十一条，适用10%的预提税率。

三、计税依据

根据《企业所得税法》第十九条及《企业所得税法条例》第七十四条，非居民企业获得的股权转让所得，以收入总额扣除资产净值后的余额为应纳税所得额。

  • 资产净值： 指相关财产的计税基础减去已计提的折旧、摊销等。

四、纳税义务人及申报流程

根据《国家税务总局关于加强非居民企业所得税源泉扣缴管理有关问题的通知》（国税函〔2009〕3号），非居民企业取得来源于中国境内的股权转让所得，由支付款项的境内企业承担代扣代缴义务。

  • 义务人： 本案例中的义务人为中国境内购买方Y有限公司。
  • 申报要求： 义务人应在签订合同后30日内向主管税务机关申请备案。

五、不缴税的后果

若义务人未履行代扣代缴义务，非居民企业应在付款或应付款之日起7日内自行向所得发生地税务机关申报纳税。如仍逾期未缴，税务机关可从其他付款人处追缴税款及滞纳金。

  • 风险提示： 不履行纳税义务可能导致严重的法律后果，包括罚款、信用受损甚至被限制在中国市场活动。

六、跨境交易中的税务安排建议

在跨境股权转让协议中，建议明确约定税收责任归属，并在合同中加入税务条款，确保各方清楚各自的责任，避免后续纠纷。