当境内有限公司的股权通过股权转让形式转移至境外的香港有限公司时，涉及的税务问题较为复杂，需结合中国及香港的税法规定综合分析。

1. 香港利得税的适用性

根据《香港税务条例》，香港利得税适用于在港经营业务并产生应税利润的实体。然而，在本案例中，转让所得来源于中国大陆，而非香港，因此该笔收入不被视为“来自香港”的应税利润，**香港有限公司无需就该交易缴纳利得税**。

2. 中国企业所得税的适用性

根据《中华人民共和国企业所得税法》第三条第三款，非居民企业（如香港有限公司）在中国境内无设立机构、场所，或虽有设立但与所得无实际联系的，其来源于中国的收入应缴纳企业所得税。

  • 税率：根据《企业所得税法》第四条第二款，适用税率为20%；但根据《企业所得税法实施条例》第九十一条，实际适用税率为10%。
  • 计税基础：以收入全额减去财产净值后的余额为应纳税所得额。财产净值指资产的税收基础减去折旧、摊销等扣除项。

3. 税款的扣缴义务

根据《国家税务总局关于非居民企业所得税源泉扣除管理暂行办法》（国税发〔2009〕3号），支付方（即境内受让方）有扣缴义务。具体要求如下：

  • 支付方应在合同签订后30日内向主管税务机关申报扣缴税务登记。
  • 若未依法扣缴，非居民企业应在支付或逾期支付之日起7日内自行向主管税务机关申报纳税。

4. 未履行扣缴义务的后果

若支付方未履行扣缴义务，税务机关可从其他支付款项中追缴税款及滞纳金。因此，**涉外股权转让协议中应明确约定税务责任归属**，以避免法律和财务风险。

5. 涉外交易中的注意事项

若交易双方均为非居民企业且交易发生在境外，仍需根据相关国家或地区的税法判断是否需要缴税。建议在交易前进行专业的税务咨询，确保合规。